本校於104年6月19日上午舉行103學年度畢業典禮，今年畢業典禮邀請到馬英九總統親臨參加，上午8時30分馬總統先參觀本校圖書館「拚創實驗室」，於9時至述耘堂參加學生畢業典禮。今年來參加本校畢業典禮的貴賓冠蓋雲集，除馬英九總統外，還邀請到總統府曾永權秘書長、教育部技職司饒邦安副司長、立法院王進士立法委員、總統府熊光華副秘書長、總統府公共事務室吳秋美主任、國安會蘇蘅諮詢委員、吉里巴斯共和國游黛姤大使(女士)H.E. Ambassador Teekoa Iuta、吐瓦魯(Tuvalu)陶敏德大使H.E. Ambassador Minute Alapati Taupo暨夫人、史瓦濟蘭The Kingdom of Swaziland首席秘書Mr. Hezekiel Dube暨夫人、吐瓦魯(Tuvalu)行政秘書 馬哲詩、泰國程逸(烏答臘迪)皇家大學校長Prof. Dr. Ruangdet Wongla 、泰國東北皇家(Rajamangala)理工大學副校長Mr. Chuchai T. Siriwattana、屏科大校友會理事長陳欽明理事長、多位企業界貴賓及美和科技大學林顯輝校長等多位南部地區大專校院與高中職校長等各界貴賓蒞臨會場，一起為全體畢業生祝福。
馬英九總統蒞臨後，先安排參觀本校「拚創實驗室」所展示的師生研究創新及創意創業成果，展示成果有3D列印、仿生魚、田間採收農產跟隨裝運車、FPGA系統整合之視覺導引機械手臂、麝香貓咖啡、水晶蝦及本校校友所創生態旅遊規劃產品。隨後總統再搭乘本校車輛系所研發電動車前往述耘堂參加畢業典禮，致詞勉勵畢業生，並頒發畢業證書給畢業生代表及合影留念。
戴昌賢校長於畢業典禮時以日本蘋果爺爺的故事勉勵畢業生懷抱「良心」、「毅力」、「樂觀」及「信心」，並效法木村阿公堅持「純天然」自然農法栽植蘋果的「傻瓜精神」進入職場及待人處事。
屏科大本年度共有2773位畢業生，其中有82名是來自世界各國的國際學生。今年有一位特別的畢業生，就讀農企系的楊弘盟同學，在升大三的暑假經歷了一場嚴重的車禍，昏迷了三個多月後，幸運的奇蹟甦醒，在辛苦復健與治療三年後，幸能回到學校就讀，透過學校各單位的協助以及父母的親情支持下，順利完成學業並考上研究所，楊生堅韌的意志與毅力，以及克服萬難、篤志向學的精神，值得嘉勉與褒揚。而楊生的父母親，楊承宗先生與莊麗美女士，更是輪流自彰化南下照料其生活起居並陪同上課，偉大的舐犢之情令人感佩。因此本校特別邀請馬總統頒發學位證書給楊生以鼓勵其好學不倦，另頒發獎狀表揚不畏辛勞助子圓夢的雙親。
在全校性畢業典禮後，本校各系所皆舉行個別畢業典禮，由各系所師長為畢業生撥穗及頒發畢業證書，畢業生致詞、感謝師長與學習生活剪影回顧、穿畢業袍合影留念，場面溫馨感人。