本校養殖系由翁韶蓮老師、李孟洲老師及吳宗孟老師合力帶領系上一群學生所組成的海藻研究團隊，在行政院農委會漁業署「臺灣沿海藍色經濟成長推動計畫」之經費支持下，已成功開發綠藻類之海葡萄與滸苔，以及紅藻類海木耳、紅翎藻、麒麟菜、長枝沙菜等可食用之海藻養殖技術，並針對民眾的寵物伙伴開發「海藻寵物零食」，提供寵物健康的零食；另已建立之紅藻類海木耳人工養殖技術，一年四季可穩定生產海木耳。屏科大海藻研究團隊透過海藻養殖技術的發展，除與養殖業者產學合作，以魚藻共生的方式將養藻後的乾淨海水養殖食斑魚，海水除可循環使用降低成本外，也能提高養殖業者的收益。
許多研究發現食用海藻具有許多優點，藻類含有抗癌、抗老化、可降低膽固醇等具醫藥價值之成分，其膳食纖維、蛋白質、胺基酸、脂肪酸及礦物質等成分，有益人體健康，因此，近年來注意養生觀念的國人也開始大量食用。根據2013年漁業署統計年報台灣進口海藻數量及價值已高達1.8萬噸和6167萬美元。為減少對進口海藻的依賴，並提供符合「藻類食品衛生標準」可安全食用之海藻，屏科大海藻研究團隊，在確保海藻養殖的衛生條件下，全部採用可常規清理的玻璃纖維材質培養桶槽，定期檢測培養用海水重金屬含量，精密儀器檢測所生產之藻種，第一階段利用高雄永安中油液化天然氣(Liquefied natural gas, LNG)製程中排放之潔淨低溫海水，成功開發綠藻類之海葡萄與滸苔，以及紅藻類海木耳、紅翎藻、麒麟菜、長枝沙菜等可食用之海藻養殖技術。為了確保海藻養殖的衛生條件，培養桶槽全部採用玻璃纖維材質，利於平日常規清理；培養用海水均定期檢測重金屬含量，生產藻種經過精密儀器檢測，完全符合「藻類食品衛生標準」，提供國人新鮮安全的海藻食材，以上技術近期亦將在農委會漁業署協助下，轉移至花蓮及臺東地區，使用「深層海水」建立新型態的科技節能養殖。
海藻具有許多功效並富含膳食纖維，可控制寵物體重、促進消化、改善腸道問題以及調降血脂。為提高海藻產業應用之價值，該校海藻研究團隊首先針對民眾的寵物伙伴開發「海藻寵物零食」，提供寵物健康的零食，添加海藻的寵物零食能預防寵物心血管疾病，目前已接受民眾訂單，客製化生產。
另已建立之紅藻類海木耳人工養殖技術，可一年四季穩定生產海木耳，本技術生產之藻體可完全符合衛福部食藥署「藻類食品衛生標準」，經適當的烹調，是極為美味的佳餚，海木耳原為小琉球的特色食材，如今可以人工培養後，將可讓更多的國人一同享受南臺灣的海藻風味。海藻研究團隊更進一步的針對青年朋友的口味，完成海木耳飲品調製及小量試量產，目前已在原生消費合作社販賣，預計將技術轉移給食品廠商進行商業生產。
本校的海藻研究團隊配合漁業署之「栽培漁業示範區」規劃，透過人工養殖技術，進行我國海域漁業資源的保護與復育，除了持續進行的漁業資源調查外，進一步的以人工培育魚苗進行計畫性放流，並同步以復育海藻增加魚苗棲地之豐富度，以提高魚苗放流後之存活率。透過海藻養殖技術的發展，提升台灣周邊海域生態之多元化。除了能夠復育海洋資源外，海藻還具有經濟性的產業價值，預期可透過量產大型藻類能夠替我國帶來更高的海藻產值及產量。
海藻養殖過程中，具有吸收二氧化碳，減少溫室氣體的效果，同時可降低對自然海域藻類的採集，維持魚類棲地的完整及海域生物多樣性。海藻研究團隊召集人翁韶蓮老師呼籲國人能多食用國產新鮮海藻，國產新鮮海藻除了營養美味，符合藻類食品衛生標準，還能減少食材運送的能源消耗。食用國產新鮮海藻，可同時對於維護食品安全、提昇漁業產業及保育海洋環境等三方面，都是極具現代人低碳環保消費的意識。
延伸閱讀
自由時報：海藻養殖技術成熟 屏科大讓產銷連線
中國時報：屏科大養殖食用海藻 製成毛小孩零食販售
台灣新生報：屏科大成功開發可食海藻
大紀元：食用海藻養殖技術 屏東科大開發成功